转录组+代谢组

背景介绍

转录组数据分析可以了解基因在不同条件下的表达差异，发现关键的调控基因和通路。代谢组数据反映了细胞或组织代谢产物及其动态变化，是生物体生理状态和功能的直接体现。将转录组和代谢组数据结合，可以探索基因表达变化如何影响代谢产物的变化，也可揭示基因表达和代谢物间的相互作用和调控机制。

研究思路

题目：Integrated analysis of the transcriptome, metabolome and analgesic effect provide insight into potential applications of different parts of Lindera aggregata

期刊：Food Research International   发表时间：2020   影响因子：7.4

结论：通过UPLC Triple TOF-MS/MS鉴定了9种异喹啉生物碱化合物。除N-甲基月桂碱外，大多数异喹啉生物碱化合物广泛分布在乌药的各个组织，这些代谢物优先在根中而不是叶片中积累。转录组表明几个异喹啉生物碱生物合成基因，如TyrAT、PPO、TDC和SOMT，在乌药生物碱在根叶中差异累积中起着重要作用。