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背景介绍
微生物扩增子测序技术是指利用高通量测序平台对样本中的微生物特定基因区域进行特异性扩增和测序，从而分析微生物群落的组成和丰度的方法。根据研究对象的不同，扩增子测序可分为以下几类：16S rRNA基因测序用于分析细菌群落结构多样性。18S rDNA为编码真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列，对其进行全长测序可用于分析真核微生物的群落结构。ITS是真核生物中18S rDNA和28S rDNA转录间隔序列，ITS全长测序可用于真菌群落结构分析。
应用方向
医学：生物标志物筛选、疾病机理研究、人体微生物群落功能研究；
植物：叶际微生物互作研究、根际微生物互作研究、病虫害防治研究
产品优势
取样要求
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样本类型 |
样本 |
建议送样量 |
最低送样量 |
生物学重复 |
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固体 |
粪便／肠道内容物 |
500mg（小鼠粪便2-3粒） |
100mg |
6 |
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拭子 |
3个 |
/ |
6 |
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土壤／污泥／沉积物 |
5g |
/ |
6 |
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组织 |
500mg |
100mg |
6 |
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液体 |
人唾液/肺泡鼻腔等灌洗液 |
5ml |
/ |
6 |
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胆汁 |
5ml |
/ |
6 |
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脑脊液 |
5ml |
/ |
6 |
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乳汁 |
1ml |
/ |
6 |
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血液 |
5ml |
/ |
6 |
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发酵液 |
5-10 mL |
/ |
6 |
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胃瘤液 |
10-15 mL |
/ |
6 |
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提取好的DNA样本 |
> 50 ng |
/ |
6 |
研究思路
题目：Influence of 16S rRNA target region on the outcome of microbiome studies in soil and saliva samples
期刊：Scientific reports 发表时间：2020 影响因子：4.9
结论：对V1V3、V3V4、V4V5和V6V8结构域进行了研究，发现虽然一些区域在某些细菌分类群的检测和α多样性的计算方面存在差异，特别是在土壤样本中，但总体效果并没有影响任何样本类型在属级分类分析方面的区分。16S rRNA靶区影响了与土壤质量和发育相关的特定细菌的检测，以及唾液中用作健康生物标志物的微生物属。
