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背景介绍
微生物宏基因组测序（Metagenomic Sequencing）能够通过对环境样品中的所有微生物群体的基因组进行直接测序和分析，从而揭示微生物的多样性、功能和相互关系。相比传统的培养方法，宏基因组测序能够提供更加全面和准确的微生物群落结构和功能信息。随着高通量测序技术的发展，宏基因组测序已经成为微生物研究中的重要工具，广泛应用于环境科学、医学研究、农业科学等领域。
应用方向
医学方向：肠道微生物研究、口腔疾病研究、生物标志物筛选、疾病机理研究
植物方向：根际微生物研究、土壤微生物群落研究、重金属与有机污染修复研究
取样要求：
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样本类型 |
样本 |
建议送样量 |
最低送样量 |
生物学重复 |
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固体 |
粪便／肠道内容物 |
500mg（小鼠粪便2-3粒） |
/ |
6 |
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土壤／污泥／沉积物／腐殖质 |
5g |
/ |
6 |
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组织 |
500mg |
/ |
6 |
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液体 |
胆汁 |
5ml |
/ |
6 |
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发酵液 |
10-20 mL |
/ |
6 |
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胃瘤液 |
20-30 mL |
/ |
6 |
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提取好的DNA样本 |
> 1 μg |
/ |
6 |
研究思路：
题目：Clinical Metagenomic Sequencing for Species Identification and Antimicrobial Resistance Prediction in Orthopedic Device Infection
期刊：Journal of Clinical Microbiology 发表时间：2022 影响因子：11.6
