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背景介绍
真核转录组测序是指利用二代高通量测序平台，对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有mRNA进行测序，从而获得基因的定量信息。根据是否有参考基因组，真核转录组测序可分为有参转录组测序和无参转录组测序。
有参转录组测序：利用Illumina平台对样本的mRNA进行测序，将获得的reads与参考基因组进行比对，能够全面快速地分析mRNA序列和丰度信息，进行基因结构和新转录本的识别。
无参转录组测序：利用Illumina平台对样本的mRNA进行测序，不依赖参考基因组，将reads进行拼接，组装出最长的转录本作为unigene，以unigene为参考进行后续分析。适用于无参考基因组的物种，或基因组未被完全测序和注释的物种。
应用方向
医学：发育生物学研究、进化生物学研究、疾病机制研究、药物反应研究、癌症机理研究
植物：生长发育研究、抗逆性研究、代谢通路研究、群体遗传学研究
取样要求
|
样本类型 |
样本 |
建议送样量 |
最低送样量 |
生物学重复 |
|
固体 |
植物组织 |
0.5g |
100mg |
3 |
|
动物/人组织 |
0.3g |
100mg |
3 |
|
|
液体 |
半固体真菌 |
0.5ml |
/ |
3 |
|
全血 |
3ml |
2ml |
3 |
|
|
血清或血浆 |
3ml |
2ml |
3 |
|
|
脑脊液 |
5ml |
2ml |
3 |
|
|
外泌体 |
20-30ug |
20-30ug |
3 |
|
|
细胞 |
新鲜培养细胞 |
5×106个 |
/ |
3 |
|
真菌 |
5×106个或0.3g |
/ |
3 |
|
|
其它 |
RNA样本（RIN>7） |
2μg |
1μg |
3 |
研究思路
题目：Single cell transcriptomic analysis of human pluripotent stem cell chondrogenesis
期刊：Nature communication 发表时间：2021 影响因子：17.6
结论：结合单细胞RNA测序和生物信息学分析研究了在软骨生成条件下调控hiPSC分化的基因调控网络。鉴定出了hiPSC软骨形成过程中神经细胞和黑素细胞脱靶分化的调控的关键基因WNTs和MITF。
